Tshepo Motsepe đã làm việc việc tại bệnh viện Bophelong, bệnh viện Mahikeng và bệnh viện Chris Hani Baragwanath ở Soweto, Nam Phi và bệnh viện Mutare, Chinhoyi, Harare và Parirenyatwa, Zambabwe. Ngoài ra, bà cũng từng là phó viện trưởng viện nghiên cứu sức khỏe sinh sản.

Ngoài liên quan đến chuyên ngành y tế, bà còn làm giám đốc không điều hành của liên doanh sức khỏe trí tuệ, thành viên của HospiceWits, chủ tịch ở trụ sở của ủy ban y tế Gauteng và là nhà tài trợ của tổ chức sức khỏe xã hội cho phụ nữ và trẻ em Nam Phi.